Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms