Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OatP29758 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OatP29758 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OatP29758 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OatP29758 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OatP29758 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms