Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprmP28828 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprmP28828 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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