Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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