Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CftrP26361 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CftrP26361 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CftrP26361 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CftrP26361 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms