Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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