Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PparaP23204 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms