Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms