Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RarbP22605 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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