Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

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Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tap1P21958 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tap1P21958 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tap1P21958 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tap1P21958 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tap1P21958 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tap1P21958 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tap1P21958 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tap1P21958 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tap1P21958 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms