Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms