Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PdgfaP20033 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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