Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18528 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18528 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18528 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms