Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18525 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18525 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18525 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18525 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18525 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18525 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms