Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpraP18052 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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PtpraP18052 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpraP18052 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PtpraP18052 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpraP18052 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpraP18052 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
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