Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sptan1P16546 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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