Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhoP15409 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhoP15409 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RhoP15409 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms