Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms