Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PolP11369 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PolP11369 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PolP11369 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms