Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms