Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxb7P09024 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb7P09024 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms