Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TtrP07309 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TtrP07309 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TtrP07309 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TtrP07309 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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