Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlkO54988 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlkO54988 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SlkO54988 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SlkO54988 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SlkO54988 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms