Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsksO54887 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsksO54887 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsksO54887 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TsksO54887 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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