Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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