Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phox2bO35690 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2bO35690 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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