Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ebi3O35228 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms