Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ArxO35085 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ArxO35085 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms