Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PbsnO08976 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms