Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn1O08788 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms