Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Barx2O08686 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms