Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MttpO08601 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MttpO08601 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms