Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm379J3QQ19 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm379J3QQ19 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Gm379J3QQ19 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Gm379J3QQ19 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm379J3QQ19 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm379J3QQ19 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm379J3QQ19 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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