Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms