Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim22J3QP37 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms