Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm21976J3QNN2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms