Protein–RNA interactions for Protein: J3QN10

Gm16434, Predicted gene 16434, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16434J3QN10 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm16434J3QN10 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm16434J3QN10 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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