Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms