Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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