Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm29394H3BIW7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm29394H3BIW7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm29394H3BIW7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms