Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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