Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r67G5E8C1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms