Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srp72F8VQC1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms