Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms