Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28048F7BCN0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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