Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5624F6ZZG8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms