Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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