Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn5F6UCX4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms