Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC067074F6RXI4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms