Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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